保靈殿是古寧頭地方一座年代久遠的廟宇，始建至今已有五百多年歷史。蓋因古寧頭居民先世自同安遷來，而保生大帝是同安白礁人，白礁和青礁各有慈濟宮祖廟各一，古寧頭先民乃於明成化年間(1465至1487年)，自白礁請火建廟奉祀，供奉境主保生大帝。本廟在民國三十八年毀於戰事，後於民國七十九年重建而成今貌。
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