水里站是集集支線中最大的一個車站,也是唯一的簡易站(派有站員)。水里站原名水裡坑驛,創設於1922年1月14日,41年12月1日改水裡站,48年8月8日改名水裏站,55年1月1日降為三等站,56年10月10日改名為水里站,78年11月1日改為簡易站。車站位在小鎮高處(站前台階頗具特色),一出站即可看到招牌林立的熱鬧街道景象,站內月台陳列著刻有站名的蛇窯陶甕,頗具地方特色,站房91年6月起進行整建。
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